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逐句释序文，明真俗、空有、中道，述弥勒世亲造论因缘。
五门分释百法明门，显唯识中道，破邪执，彰圆实宗。
释百法明门，明唯识真俗，论转依六种，破外道邪执。
五门禅法，以离念为宗，明心体离念即佛，一念净心顿超佛地。
居士问禅师答，明心性本净、顿悟成佛，论三身四智及不假修证之旨。
释大乘四法经，明经题、六成就、四法义及七大修行。
广释四法经论，明六成就、菩提心及忍辱柔和等菩萨行。
列大乘斋日及所值神祇，明持斋念佛免地狱苦、除罪劫数。
尚不起一切对治心，超越善恶分别，直显本净心性。
五言赞偈，明心净则土净，劝返照自心，念佛入禅。
依唯识五位次第，释菩萨修行阶位及转依成佛之道。
二十二问答，论菩萨行、佛身、涅槃、发心等大乘深义。
十斋日念诸佛菩萨，免地狱苦，除罪劫，劝持斋修善。
释菩萨道品、止观及六巧便，明自利利他，破相显真。
释十二因缘，明三道摄支，破外道异执，显缘起性空。
唐代回向文，为帝王、僧俗等祈福，愿寿康福庆。
汇编四部律及论典要义，明受戒、结界等十七门僧行轨则。
释五受法、作无作戒体，明止作二持及犯忏义。
释唯识三十颂，明八识三性，辨境空识有，示修行位次。
以偈颂说菩萨十重戒，示犯戒果报，劝众生忏悔持戒。
为太保禳灾祈福，印沙供佛，回向护国延寿，消灾息兵。
释禅定观门七种，示念佛十益，明心性寂照之旨。
逐品释华严经三十四品来意，明修行次第，附四弘誓。
释光明觉品，破佛身周遍之疑，明色心皆遍十方。
