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明代官修编年体史书，记载明宪宗成化朝史事，为研究明代中期核心史料。
官修编年体记载明思宗崇祯朝史事，为研究明末核心史料。
官修编年体记载明武宗正德朝史事，为研究明代中期核心史料。
官修编年体记载明熹宗天启朝史事，为研究明末核心史料。
明代官修编年体史书，记载明神宗万历朝四十八年史事，为研究明史核心史料。
官修编年体记载明穆宗隆庆朝史事，为研究明代中期核心史料。
明代官修编年体史书，记载明英宗三朝史事，为研究明中期核心史料。
辑录明实录中闽海地区海防、通商、朝贡及倭患史料，反映明代中期海疆实况。
吕毖辑明初洪武朝轶事掌故，多神异传说，可补正史之阙。
辑录明清徽州商帮原始史料，为研究徽商及社会经济重要资料汇编。
辑录清初内务府档案中曹氏织造活动文件，为研究曹家及清史重要史料。
缪荃孙等纂，编年体记载江苏从周秦至清末大事，为江苏通史核心资料。
清代档案汇编，记中法战争期间法国侵台经过及清廷海防、外交始末。
辑录清光绪朝中法战争涉台原始档案，反映台湾海防及外交交涉实况。
选录清代淡水新竹行政档案，反映台湾基层官治与社会运作实况。
选录清世宗实录中涉台谕旨奏议，反映雍正朝对台治理及番社归化实况。
选录清世祖实录中涉台史料，反映清初对台招抚与郑氏抗清实况。
辑录乾隆朝文字狱原始档案，分案汇编谕旨、奏折、供状，为研究清代文化专制重要史料。
选录光绪朝中日交涉原始档案，反映甲午战争前后外交与军事态势。
从《清史稿》中选辑清代历朝涉台史料，反映清廷对台统治与军事经略。
清代官修太祖实录，记努尔哈赤起兵及统一女真各部史事。
辑录清季台湾洋务档案，反映电报、矿务、铁路等近代化建设与海防实况。
辑录晚清中法战争涉台外交原始文件，反映台海战事与列强交涉实况。
清代官修编年体史书，记载乾隆皇帝在位六十余年政务与重大事件。
